福建省南方经济作物遗传育种与多用途开发国际科技合作基地于2014年获得福建省科技厅批准成立,依托福建农林大学农学院作物学学科和国际学院建设。以南方经济作物为研究对象,以种质资源为基础,基因挖掘为核心,选育品种为目标,多功能利用为手段,开展南方经济作物科学基础应用研究。与尼日利亚、卢旺达、巴基斯坦、缅甸、马来西亚、印度、孟加拉国等国家开展作物遗传育种与多用途综合利用的教学与研究工作。